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| Registros recuperados : 5 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/07/2019 |
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Data da última atualização: |
07/04/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MARCIANO, L. E. A.; MAIA, R. de O. G.; SANTOS; DUARTE, I. N. H.; BERNARDES, P. A.; CHUD, T. C. S.; REGITANO, L. C. de A.; BUZANSKAS, M. E. |
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Afiliação: |
Luany Emanuella Araujo Marciano, UFPB; Ryan de Oliveira Gonçalves MAIA, UFPB; Marta da Silva Santos, UFPB; Igor Nelson Herculano DUARTE, UFPB; Priscila Arrigucci Bernardes, UNESP; Tatiane Cristina Seleguim CHUD, University of Guelph; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Marcos Eli Buzangas, UFPB. |
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Título: |
Estratégias de imputação em gado Canchim utilizando população de referência da raça Nelore. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais eletrônicos. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2018. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
The use of genomic tools in animal breeding has been widely applied to improve productivity. Imputation methods could be used to reduce genotyping costs and increase the amount of genomic information, which are needed for various studies. The aim of this study was to consider the Canchim cattle (a composite beef breed) as target population and the Nelore breed as reference population to evaluate the imputation accuracy. A total of 285 Canchim, 114 MA genetic group and 814 Nelore animals were used in this study. Imputation was carried out using the FImpute software and genotype imputation accuracy was measured by concordance rate (CR) and allelic R square (R2). Five imputation scenarios were tested and CR results varied from 64.71% to 89.69%. The R2 varied from 0.63 to 0.91. High accuracy was obtained in the scenario considering Nelore and Canchim as reference population and MA animals as target. Despite of presenting acceptable accuracies, which indicates the possibility of using Nelore genotypes for imputing genetic markers in Canchim and MA animals, other studies should be carried out to evaluate different reference populations to obtain greater accuracies. |
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Palavras-Chave: |
Marcadores moleculares; Raça composta. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado de Corte; Melhoramento Genético Animal; Reprodução Animal. |
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Thesaurus NAL: |
Animal breeding; Beef cattle. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/199874/1/2018-trab-0112.pdf
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Marc: |
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520 $aThe use of genomic tools in animal breeding has been widely applied to improve productivity. Imputation methods could be used to reduce genotyping costs and increase the amount of genomic information, which are needed for various studies. The aim of this study was to consider the Canchim cattle (a composite beef breed) as target population and the Nelore breed as reference population to evaluate the imputation accuracy. A total of 285 Canchim, 114 MA genetic group and 814 Nelore animals were used in this study. Imputation was carried out using the FImpute software and genotype imputation accuracy was measured by concordance rate (CR) and allelic R square (R2). Five imputation scenarios were tested and CR results varied from 64.71% to 89.69%. The R2 varied from 0.63 to 0.91. High accuracy was obtained in the scenario considering Nelore and Canchim as reference population and MA animals as target. Despite of presenting acceptable accuracies, which indicates the possibility of using Nelore genotypes for imputing genetic markers in Canchim and MA animals, other studies should be carried out to evaluate different reference populations to obtain greater accuracies.
650 $aAnimal breeding
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
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Registro completo
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Biblioteca(s): |
Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental. |
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Identificador: |
935 |
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Data corrente: |
09/05/2002 |
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Data da última atualização: |
25/05/2015 |
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Código do título: |
0905093 |
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ISSN: |
0102-6771 |
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Código CCN: |
006226-X |
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Título e Subtítulo: |
ANUARIO ESTATISTICO DO AMAPA |
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Entidade: |
Secretaria de Planejamento e Coordenacao |
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Local de publicação: |
Macapa, AP |
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Periodicidade: |
Anual |
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Inicio de publicação: |
1952 |
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Coleções da unidade: |
Embrapa Amapá
1982 (30); 1983 (31); 1984 (32); 1985 (33); 1986 (34); 1987 (35); 1988 (36); 1989 (37); 1990 (37); 1991 (38); 1992 (39); 1993-1994 (40) 1995-1997 41 (CD 00066); 1998-2000 (42) (CD 0048)
Embrapa Amazônia Oriental
1973 21; 1979 27; 1982 30; 1983 31; 1984 32; 1985 33; 1986 34; 1987 35; 1988 36; 1989 37; 1991 38
Classificação: 318.11605A1 |
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